| Ketua Presidium | Susana Florika M. Kandaimu | |
| Presidium Pengembangan Organisasi | Christiardo Sihombing | (Bandung) |
| Presidium Pendidikan dan Kaderisasi | Marianus D. Humau | (Kupang) |
| Presidium Gerakan Kemasyarakatan | Yohanes Tola | (Yogyakarta) |
| Presidium Hubungan Perguruan Tinggi | Goldensius Jaran Ritalangun | (Malang) |
| Presidium Hubungan Masyarakatan Katolik | Yohanes Nardi Nandeng | (Ruteng) |
| Presidium Hubungan Luar Negeri | Ferdinandus Ate | (Bogor) |
| Presidium Riset dan Teknologi | Yohanes Gunardi Karmon | (Samarinda) |
| Sekretaris Jenderal | Maria A.F.G. Sukmaniara | (Jakarta Pusat) |
| Wakil Sekretaris Jenderal I | Dela Endang Tri | (Balikpapan) |
| Bendahara Umum | Meisatari Putri Vermanari | (Manado) |
| Wakil Bendahara Umum I | Karmila Flora Daro | (Jakarta Pusat) |
| Wakil Bendahara Umum II | Novren Wilindari Molika | (Balikpapan) |
| Wakil Bendahara Umum III | Maria Thalia Ohoitimur | (Jayapura) |
| Lembaga Kajian Isu Papua | Gerad Kosamah | (Jayapura) |
| Lembaga Ekologi dan Masyarakat Adat | Mario Mere (Ketua) | (Merauke) |
| Joko Godo Kadu | (Tambolaka) | |
| Lembaga Advokasi Hukum dan HAM | Jufly Dionisius Pandey (Ketua) | (Manado) |
| Amandus Yumte | (Manado) | |
| Lembaga Ekonomi Kreatif | Marten Taiget | (Jayapura) |
| Lembaga Literasi Bangsa | Yuvensius Seran (Ketua) | (Kefamenanu) |
| Frensianis Lani | (Jayapura) | |
| Lembaga Kajian Politik dan Demokrasi | Firmus Rigo (Ketua) | (Ende) |
| Agustinus Neno | (Atambua) | |
| Lembaga Pemberdayaan Perempuan | Kristina Elia Purba (Ketua) | (Siantar) |
| Blandina Kukuro | (Merauke) | |
| Lembaga Pariwisata dan Desa | Parlin Siholaho (Ketua) | (Jambi) |
| Marsel Rian Hemat | (Alor) | |
| Simfroanus Gusti | (Labuan Bajo) | |
| Lembaga Kajian Isu Kemaritiman | Falentinus Jimmy Laka | (Jakarta Pusat) |
| Lembaga Energi dan Sumberdaya Manusia | Maryanus La Mada (Ketua) | (Kendari) |
| Yohanes Masan Bedanaen | (Larantuka) | |
| Lembaga Kesehatan dan Gizi Nasional | Rufinus Kaimbe Awi | (Merauke) |
| Lembaga Media dan Pers | Aurelius Maria De Quirino (Ketua) | (Bogor) |
| Floriana Bunga | (Malang) | |
| Komda Sumatera Utara - Nangroe Aceh | Sintong Sinaga | (Medan) |
| Komda Sumatera bagian Tengah | Jhon Making | |
| Komda Sumatera bagian Selatan | - | |
| Komda Jawa Barat | - | |
| Komda Jawa Tengah - DI Yogyakarta | Bremana | (Semarang) |
| Komda Jawa Timur - Bali | Popin Kurniawan | |
| Komda Kalimantan Barat | Endro Ronianus | |
| Komda Kalimantan Tengah | Priskialus Trilentas | |
| Komda Kalimantan Timur | - | |
| Komda Sulawesi Utara | - | |
| Komda Sulawesi Selatan | - | |
| Komda Nusa Tenggara | - | |
| Komda Timor | Antonius Uspupu | |
| Komda Maluku | - | |
| Komda Papua | Martinus Mabel | |
| Komda Papua Barat | Yostan P. Hilapok | |
| Komda Papua Barat Daya | Yance Yesnat | |
| Ex Officio | Rikardus Redja | (Ketua Presidium PMKRI Jakarta Pusat) |
| Dewan Pertimbangan | Dr. drg. Paulus Januar, M.Si., CMC | |
| M.M. Restu Hapsari, S.S. | ||
| Robert Na Endi Jaweng, S.I.P., M.A.P | ||
| Emanuel Melkiades Laka Lena, S.Si., Apt. | ||
| Hironimus Hilapok, M.Si. | ||
| Dr. Ir. Marvin S. Komber, MM., CTT | ||
| Angelius Wake Kako, S.Pd., M.Si. | ||
| Carolus K.K. Boli, S.E., M.M. | ||
| Dr. Petrus Ambarura, S.Pd., M.Pd. | ||
| Prof. Dr. Ir. Apolo Sapanfo, S.T., M.T., IPM | ||
| Drs. Romanus Mbaraka, MT | ||
| Dr. drg. Aloysius Giyai, M.Kes | ||
| Emmanuel Josafat Tular, S.IP., M.Si. | ||
| Ferlansius Pangalila S.H., M.Hum. | ||
| R. Wahyu Handoko Yulianto, S.Sos., M.M. (IRCP) | ||
| Natalius Pigai, S.IP. |
Berdasarkan Keputusan Mandataris MPA No IV/SK/FT/I-F/10/2025